RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 SNTG1Q9NSN8 517 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF6Q9Y252 685 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 AP1G1O43747 822 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SOD1P00441 154 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GPX2P18283 190 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 NTSR1P30989 418 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 BCAP31P51572 246 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 XKP51811 444 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 DCDC1P59894 354 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PRSS53Q2L4Q9 553 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF311Q5JNZ3 666 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 LRIF1Q5T3J3 769 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CADM2Q8N3J6 435 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 MYDGFQ969H8 173 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 APOOQ9BUR5 198 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR174Q9BXC1 333 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 DCSTAMPQ9H295 470 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SLAMF7Q9NQ25 335 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ASXL3Q9C0F0 2248 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 UNC13CQ8NB66 2214 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SPTBN2O15020 2390 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GASTP01350 101 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GSTM5P46439 218 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ISL1P61371 349 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS1Q08116 209 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 AMZ1Q400G9 498 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 FCRLBQ6BAA4 426 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ACOT4Q8N9L9 421 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GATSQ8NAP1 163 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL28Q9NXS3 571 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TBC1D29Q9UFV1 150 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 MAFFQ9ULX9 164 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC35G6P0C7Q6 338 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CBLP22681 906 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 DRD3P35462 400 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR4P46093 362 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF691Q5VV52 312 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 MLIPQ5VWP3 458 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 HSDL2Q6YN16 418 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 AMIGO1Q86WK6 493 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5K2Q8NHB8 316 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC115Q96NT0 180 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OR51E2Q9H255 320 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OR52A5Q9H2C5 316 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 HRASLS2Q9NWW9 162 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 BTNL2Q9UIR0 455 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 EPOPA6NHQ4 379 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 WWP2O00308 870 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 UQCRC2P22695 453 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GADD45AP24522 165 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 RCVRNP35243 200 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 BCL6P41182 706 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL4DP49703 201 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SPERTQ8NA61 448 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TM4SF18Q96CE8 201 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM83CQ9BQN1 747 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 UBXN2BQ14CS0 331 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CDC73Q6P1J9 531 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 BTLAQ7Z6A9 289 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPSQ8N2Z9 138 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 METTL4Q8N3J2 472 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC01555Q8NAE3 123 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJB8Q8NHS0 232 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 FNDC8Q8TC99 324 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2M4Q96R27 311 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PIP5K1AQ99755 562 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 BRF2Q9HAW0 419 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PPIL1Q9Y3C6 166 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TLR4O00206 839 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 EFEMP2O95967 443 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GKN3PP0CG01 181 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CHRNB1P11230 501 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GNG2P59768 71 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TGM3Q08188 693 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 VN1R5Q7Z5H4 357 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 VRK2Q86Y07 508 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR51V1Q9H2C8 321 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ERGIC3Q9Y282 383 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CACNA1EQ15878 2313 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms