RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416893.2

ATG4AP1-201, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ATG4AP1, Length 538 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AP1-201ENST00000416893 CLCA1A8K7I4 914 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 AGAP14A8MT82 685 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 D6RAR5 112 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 H7C0S8 307 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 JTBO76095 146 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TMEM63AO94886 807 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 EML2O95834 649 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 GAS8O95995 478 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 KRT16P08779 473 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 OCM2P0CE71 109 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 PRSS56P0CW18 603 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TPSB2P20231 275 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 MSH3P20585 1137 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ADRA1DP25100 572 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 PCSK6P29122 969 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TYK2P29597 1187 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 AKT1P31749 480 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 FOXN2P32314 431 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 HADHAP40939 763 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ABCG1P45844 678 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CLCNKAP51800 687 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CTSCP53634 463 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 PRKAG1P54619 331 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 NAA20P61599 178 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CRADDP78560 199 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CDK16Q00536 496 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 B4GALNT1Q00973 533 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 E2F1Q01094 437 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC34A1Q06495 639 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CDC20Q12834 499 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC29A2Q14542 456 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TPSAB1Q15661 275 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 NPTX1Q15818 432 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 GPR33Q49SQ1 333 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 C14orf28Q4W4Y0 310 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 IGSF11Q5DX21 431 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ANKRD22Q5VYY1 191 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 DET1Q7L5Y6 550 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SNX20Q7Z614 316 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SFRP1Q8N474 314 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TTLQ8NG68 377 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 OR6C4Q8NGE1 309 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF398Q8TD17 642 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CPT1BQ92523 772 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ULK4Q96C45 1275 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF778Q96MU6 729 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TTC25Q96NG3 672 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZIM3Q96PE6 472 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 RANBP9Q96S59 729 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 GON7Q9BXV9 100 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 IL22Q9GZX6 179 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ASB8Q9H765 288 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SP140LQ9H930 580 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 POLE3Q9NRF9 147 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 NMRK1Q9NWW6 199 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 BFARQ9NZS9 450 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 RNF14Q9UBS8 474 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 DKK4Q9UBT3 224 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 ATP6V1HQ9UI12 483 aa4.63□□□□□ -1.67
ATG4AP1-201ENST00000416893 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms