RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 KRT12Q99456 494 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PHACTR1Q9C0D0 580 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PLAC1Q9HBJ0 212 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 WWOXQ9NZC7 414 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ANK2Q01484 3957 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 RNF223E7ERA6 249 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 OR10H2O60403 315 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TGM6O95932 706 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SETDB1Q15047 1291 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 VWA1Q6PCB0 445 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 HIPK1Q86Z02 1210 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 IGDCC3Q8IVU1 814 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SNX31Q8N9S9 440 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM171Q8WVE6 324 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 VPS39Q96JC1 886 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB11Q9BUY7 163 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PRM3Q9NNZ6 103 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRE2Q9UHX3 823 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PLOD2O00469 737 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TTC4O95801 387 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 F12P00748 615 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 HSPA7P48741 367 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PCYT1AP49585 367 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ATP5J2P56134 94 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 RPP38P78345 283 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TNFRSF17Q02223 184 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TGFBIQ15582 683 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 MSS51Q4VC12 460 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 OR4C11Q6IEV9 310 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ENPP6Q6UWR7 440 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 GPR180Q86V85 440 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 RDH11Q8TC12 318 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 UCN3Q969E3 161 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SERHLQ9NQF3 203 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A12Q9NXJ0 267 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 USF3Q68DE3 2245 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CR1P17927 2039 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PS29 197 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 GPR75O95800 540 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 EPORP19235 508 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CHMP24386 653 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 GCKP35557 465 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 GGT5P36269 586 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 UGT2B10P36537 528 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PTGDSP41222 190 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TMED10P49755 219 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 LAPTM5Q13571 262 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 BTLAQ7Z6A9 289 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PPIL6Q8IXY8 311 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 RNF175Q8N4F7 328 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 OR14L1PQ8NHC6 308 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ADIPOR1Q96A54 375 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PGM2Q96G03 612 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 RBSNQ9H1K0 784 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 OR51B5Q9H339 312 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 MAPRE3Q9UPY8 281 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 GLOD5A6NK44 160 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CT62P0C5K7 136 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PCNAP12004 261 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 POU2F1P14859 743 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 LHX2P50458 406 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 GFRA1P56159 465 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R39P59534 338 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 IRF8Q02556 426 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 FUT7Q11130 342 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CHIT1Q13231 466 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC12BQ2HXU8 276 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PAGE2BQ5JRK9 111 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 DEPDC1Q5TB30 811 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD34AQ69YU3 496 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 NODALQ96S42 347 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 OR2B2Q9GZK3 357 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 METTL7AQ9H8H3 244 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT9Q9HCQ5 603 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 YAE1D1Q9NRH1 226 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 HCRTR2O43614 444 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ICOSLGO75144 302 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 STK16O75716 305 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 PLAUP00749 431 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD12-201ENST00000404162 ABCD3P28288 659 aa17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms