RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 HLCSP50747 726 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 DUSP2Q05923 314 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 OR1C1Q15619 314 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 MPEG1Q2M385 716 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 COLEC12Q5KU26 742 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CKAP2Q8WWK9 683 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 CTHRC1Q96CG8 243 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 LRFN1Q9P244 771 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM200CA6NKL6 621 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SLC28A2O43868 658 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SLITRK5O94991 958 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 G6PDP11413 515 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 MGAT2Q10469 447 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PDE7AQ13946 482 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PTGR1Q14914 329 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 LTB4RQ15722 352 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 FAM111BQ6SJ93 734 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 OR9A2Q8NGT5 310 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 GAL3ST4Q96RP7 486 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 LUZP4Q9P127 313 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 BCAP29Q9UHQ4 241 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PDPK1O15530 556 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PRAMEF2O60811 474 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 CD46P15529 392 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 S1PR1P21453 382 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF628Q5EBL2 1059 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.664e-7■■□□□ 11.5
FAAP20-204ENST00000400919 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF615Q8N8J6 731 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 Q8NA96 180 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ZFP28Q8NHY6 868 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SLC22A8Q8TCC7 542 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ASB15Q8WXK1 588 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM125Q96AQ2 219 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 WWTR1Q9GZV5 400 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ATAD3AQ9NVI7 634 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF639Q9UID6 485 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SDHDO14521 159 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 CLPSP04118 112 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PTGER1P34995 402 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 EBPQ15125 230 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SPINK14Q6IE38 97 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 OGFOD2Q6N063 350 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 NATD1Q8N6N6 113 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 C5orf34Q96MH7 638 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 AMDHD1Q96NU7 426 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 RASL10BQ96S79 203 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 EPN3Q9H201 632 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 GLIPR2Q9H4G4 154 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PRODH2Q9UF12 536 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ATP6V1HQ9UI12 483 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 BSNQ9UPA5 3926 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 A8MVJ9 347 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 EPHA3P29320 983 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 CLDN8P56748 225 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PRSS53Q2L4Q9 553 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PIGGQ5H8A4 983 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF766Q5HY98 468 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 CPTPQ5TA50 214 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 OPN5Q6U736 354 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 TAGAPQ8N103 731 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SLC15A4Q8N697 577 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 KAT2AQ92830 837 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 TP53INP1Q96A56 240 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 HPF1Q9NWY4 346 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ERVK-11Q9UQG0 969 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 PLOD3O60568 738 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 DIO3P55073 304 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 MANFP55145 182 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 NXNQ6DKJ4 435 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 RGS9BPQ6ZS82 235 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM178AQ8NBL3 297 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 MDS2Q8NDY4 140 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 C17orf47Q8NEP4 570 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 C16orf52Q8NHV5 167 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 USH1CQ9Y6N9 552 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 CFAP46Q8IYW2 2715 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-204ENST00000400919 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms