RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399598.6

UBXN2B-201, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN2B, Length 5,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-201ENST00000399598 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NAGSQ8N159 534 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SCRN2Q96FV2 425 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MYADML2A6NDP7 307 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PEX12O00623 359 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 LCKP06239 509 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 DRD2P14416 443 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM25Q86YD3 366 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CHST14Q8NCH0 376 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SOX30O94993 753 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SFTPBP07988 381 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TRAM1Q15629 374 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SGCAQ16586 387 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CCDC58Q4VC31 144 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 XKRXQ6PP77 449 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TMIEQ8NEW7 156 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SORT1Q99523 831 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 IL26Q9NPH9 171 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NLKQ9UBE8 527 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PRELID1Q9Y255 219 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 LATO43561 262 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ADAP00813 363 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 HEXBP07686 556 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CLRN1P58418 232 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NTRK2Q16620 822 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 KCNN1Q92952 543 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SGTBQ96EQ0 304 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CD93Q9NPY3 652 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 DKKL1Q9UK85 242 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MYH11P35749 1972 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 IL1RNP18510 177 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TAS2R38P59533 333 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 DHCR24Q15392 516 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CD200R1Q8TD46 325 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ASB6Q9NWX5 421 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 DHDHQ9UQ10 334 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 GPR143P51810 404 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PPP5CP53041 499 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 MSANTD3Q96H12 275 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 FZD3Q9NPG1 666 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 SSX6Q7RTT6 188 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 OR1A2Q9Y585 309 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 A0A1B0GVC2 190 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 IL7P13232 177 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 VIPR2P41587 438 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN2B-201ENST00000399598 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms