RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PROS1P07225 676 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 FESP07332 822 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 C8orf89P0DMQ9 161 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TYRP1P17643 537 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TTKP33981 857 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 MC3RP41968 323 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 LSSP48449 732 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PXNP49023 591 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 HLCSP50747 726 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 DAPP51397 102 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 XKP51811 444 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PRKAG1P54619 331 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 EPHA4P54764 986 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CDH12P55289 794 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 MAZP56270 477 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SMIM11AP58511 58 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 GABARAPL2P60520 117 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 HPCAP84074 193 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 IL1RL1Q01638 556 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFA9Q16795 377 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 NADK2Q4G0N4 442 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF691Q5VV52 312 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 USP53Q70EK8 1073 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 OR4N4Q8N0Y3 316 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TAGAPQ8N103 731 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 DEFB119Q8N690 84 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SMYD1Q8NB12 490 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 NUP43Q8NFH3 380 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 OR9A2Q8NGT5 310 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 KLHL6Q8WZ60 621 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 UCN3Q969E3 161 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ELP4Q96EB1 424 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TCTN2Q96GX1 697 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 MAGED4Q96JG8 741 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PSD2Q9BQI7 771 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ACTRT3Q9BYD9 372 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 KLHL25Q9H0H3 589 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SERHL2Q9H4I8 314 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 RIBC2Q9H4K1 309 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ANKHQ9HCJ1 492 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 KCMF1Q9P0J7 381 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PTGFRNQ9P2B2 879 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SPAG17Q6Q759 2223 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 UNC80Q8N2C7 3258 aa10.48□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 NINQ8N4C6 2090 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PRAMEF10O60809 474 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 GADD45GO95257 159 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CPMP14384 443 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ST6GAL1P15907 406 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CD247P20963 164 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PIGAP37287 484 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 OR1E2P47887 323 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 KCNJ5P48544 419 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 NUP107P57740 925 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 RUNX2Q13950 521 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 GPR19Q15760 415 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 MICAQ29983 383 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 FOXB2Q5VYV0 432 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SFTPA2Q8IWL1 248 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 OR5D16Q8NGK9 328 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 DNASE2BQ8WZ79 361 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 NR4A3Q92570 626 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TANKQ92844 425 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 COL21A1Q96P44 957 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CD180Q99467 661 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 TSC22D3Q99576 134 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 GABARAPL3Q9BY60 117 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 ADNPQ9H2P0 1102 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 NTMQ9P121 344 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 EPHA6Q9UF33 1036 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 CLCA2Q9UQC9 943 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 SIT1Q9Y3P8 196 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 GMPPBQ9Y5P6 360 aa10.47□□□□□ -0.73
CTXN3-202ENST00000395322 THADAQ6YHU6 1953 aa10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms