RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 JADE3Q92613 823 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 V9GYQ6 96 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 CXCR6O00574 342 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 DSTNP60981 165 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 RHAGQ02094 409 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 OCA2Q04671 838 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MGAT2Q10469 447 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 GLYATQ6IB77 296 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 STMN2Q93045 179 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MR1Q95460 341 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 OR51I1Q9H343 314 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MMACHCQ9Y4U1 282 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 GMEB1Q9Y692 573 aa16.63■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 HRKO00198 91 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PLD2O14939 933 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MGRN1O60291 552 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF21O75509 655 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 SLC34A2O95436 690 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PRIM2P49643 509 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PGDP52209 483 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 VAC14Q08AM6 782 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 FADDQ13158 208 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 VMACQ2NL98 169 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 QSOX2Q6ZRP7 698 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 RIT1Q92963 219 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 FAM162AQ96A26 154 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 CNPPD1Q9BV87 410 aa16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 OR12D1P0DN82 309 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 TNNI3P19429 210 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 AGXTP21549 392 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MATN1P21941 496 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 AQP1P29972 269 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 STT3AP46977 705 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 KHKP50053 298 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 FHL5Q5TD97 284 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 LCN8Q6JVE9 175 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 OR2L13Q8N349 312 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 TNIP2Q8NFZ5 429 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 ZNF675Q8TD23 568 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MOAP1Q96BY2 351 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MS4A4EQ96PG1 132 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 TRIM15Q9C019 465 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 MUC13Q9H3R2 512 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 SATB2Q9UPW6 733 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 SPEGQ15772 3267 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PLOD2O00469 737 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 GMNNO75496 209 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 STK17BO94768 372 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 PSMG1O95456 288 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 ATP6V1G2O95670 118 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 RECKO95980 971 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 IL10P22301 178 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 POLE2P56282 527 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 RAB15P59190 212 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 SERTAD2Q14140 314 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 NSDHLQ15738 373 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 FXNQ16595 210 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 OLIG3Q7RTU3 272 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 NETO1Q8TDF5 533 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 GIMAP5Q96F15 307 aa16.61■□□□□ 0.25
LTV1-201ENST00000367576 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms