RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SUN5Q8TC36 379 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 EPHA6Q9UF33 1036 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RBBP9O75884 186 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PIGFQ07326 219 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FCAMRQ8WWV6 532 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP10Q96AY3 582 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF217O75362 1048 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RETP07949 1114 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GABARAPL2P60520 117 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ACTA2P62736 377 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ACTG2P63267 376 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GBX1Q14549 363 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SOCS2O14508 198 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RABIFP47224 123 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CENPSQ8N2Z9 138 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NAXEQ8NCW5 288 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 AIFM2Q9BRQ8 373 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM165Q9HC07 324 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 WASF3Q9UPY6 502 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GPR37L1O60883 481 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SNAPC5O75971 98 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FCER2P06734 321 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RORAP35398 523 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CHRDL2Q6WN34 429 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PROKR1Q8TCW9 393 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC120Q96HB5 630 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 BMFQ96LC9 184 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 THEGLP0DJG4 465 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 S100A10P60903 97 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SHC2P98077 582 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GRK1Q15835 563 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SGCAQ16586 387 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF852Q6ZMS4 543 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 B4GALT7Q9UBV7 327 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RARRES3Q9UL19 164 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC4EQ9ULY5 219 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LSM1O15116 133 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MS4A15Q8N5U1 240 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GLS2Q9UI32 602 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HSPB11Q9Y547 144 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SLC1A7O00341 560 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1G1O75348 118 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 IER5LQ5T953 404 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM236Q5W0B7 351 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A8Q8TCC7 542 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 BRF2Q9HAW0 419 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SH3D21A4FU49 640 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 JRKO75564 520 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SCGB1D2O95969 90 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 IL4RP24394 825 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TSC22D1Q15714 1073 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LRRN1Q6UXK5 716 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PIANPQ8IYJ0 282 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CPXM2Q8N436 756 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ACVR1CQ8NER5 493 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF559Q9BR84 538 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ARNT2Q9HBZ2 717 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ACTL7AQ9Y615 435 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ASRGL1Q7L266 308 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LPAR4Q99677 370 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ACTRT3Q9BYD9 372 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RDH14Q9HBH5 336 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 DHDHQ9UQ10 334 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PADI2Q9Y2J8 665 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PRKYO43930 277 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LILRB3O75022 631 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 UGT2B10P36537 528 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FRKP42685 505 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FXYD6P3P58550 94 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 IL22RA1Q8N6P7 574 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf58Q8NDZ4 430 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF700Q9H0M5 742 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LAMTOR5O43504 91 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RPS17P08708 135 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA3P12429 323 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 FAM189BP81408 668 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ALG10BQ5I7T1 473 aa19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms