RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHROOM3Q8TF72 1996 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LTBP4Q8N2S1 1624 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0J9YXY3 114 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MACROD2A1Z1Q3 448 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMB11A5LHX3 300 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGAP14A8MT82 685 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 C16orf90A8MZG2 172 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM150CB9EJG8 249 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 C11orf94C9JXX5 98 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GFYI3L273 518 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PES1O00541 588 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENTPD3O75355 529 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTP4A3O75365 173 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF254O75437 659 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 BBOX1O75936 387 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANXA9O76027 345 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOL4O94818 638 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUDT14O95848 222 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHOXF2BP0C7M4 288 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZCCHC18P0CG32 403 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT3P12035 628 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNH1P13489 461 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADRB3P13945 408 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERCC2P18074 760 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GCH1P30793 250 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAN1A1P33908 653 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCGF2P35227 344 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIMK1P53667 647 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEFB116Q30KQ4 102 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CMPK2Q5EBM0 449 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCAF12Q5T6F0 453 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL10Q6JEL2 608 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF880Q6PDB4 577 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SASS6Q6UVJ0 657 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXCL17Q6UXB2 119 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF165Q6ZSG1 346 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRA10AC1Q70Z53 315 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEGR1Q7Z3B1 354 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SZRD1Q7Z422 152 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMKMTQ7Z624 323 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLFN11Q7Z7L1 901 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TDHQ8IZJ6 230 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC30BQ8N4P2 665 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ICA1LQ8NDH6 482 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 APPL2Q8NEU8 664 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR6X1Q8NH79 312 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC26A7Q8TE54 656 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 UCMAQ8WVF2 138 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEIL2Q969S2 332 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PELI1Q96FA3 418 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC3BQ96PB8 259 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSSK2Q96PF2 358 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERGIC2Q96RQ1 377 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB40CQ96S21 281 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NACAP1Q9BZK3 213 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM9Q9C026 710 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF350Q9GZX5 532 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPK1Q9H3S4 243 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q9HAA7 133 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB9BQ9NP90 201 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCB8Q9NUT2 735 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 EXD2Q9NVH0 621 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJC11Q9NVH1 559 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ONECUT1Q9UBC0 465 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPIAL4EA0A075B759 164 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PPW3 197 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PI4KAP2A4QPH2 592 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGPEP1LA6NFU8 196 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GLOD5A6NK44 160 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 B4E171 279 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPIAL4DF5H284 164 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 K7ERI5 159 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA0513O60268 411 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 USO1O60763 962 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBX10O75333 385 aa-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms