RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6K2Q8NGY2 324 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SMPDL3AQ92484 453 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF225Q9UK10 706 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PXDNQ92626 1479 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SNCGO76070 127 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CHAF1BQ13112 559 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SAMD7Q7Z3H4 446 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ZMIZ2Q8NF64 920 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 AUTS2Q8WXX7 1259 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PHYHIPQ92561 330 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 BPIP17213 487 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB35Q15286 201 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ENPP7Q6UWV6 458 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 LACC1Q8IV20 430 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 OR51J1Q9H342 316 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 IL37Q9NZH6 218 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3BA6NDS4 549 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 NFKBIEO00221 500 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 OR8U9P0C7N5 309 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR19Q15760 415 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 BATFQ16520 125 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXL4Q9UKA2 621 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CACNG2Q9Y698 323 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 UGDHO60701 494 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TFAP2AP05549 437 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAIN1P0CW23 69 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CALCRP30988 508 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ETV3P41162 512 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR88Q6ZMY6 472 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CFAP52Q8N1V2 620 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ACBD7Q8N6N7 88 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2AP1Q8NGE2 309 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC46Q96FV0 321 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RBP7Q96R05 134 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CHD5Q8TDI0 1954 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PRPS1P60891 318 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 DTLQ9NZJ0 730 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXW2Q9UKT8 454 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MAST2Q6P0Q8 1798 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TXNL1O43396 289 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TLR5O60602 858 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 THBS2P35442 1172 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 HSD17B7P56937 341 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 NKX3-2P78367 333 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TLE4Q04727 773 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CPNE8Q86YQ8 564 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 OR7A17O14581 309 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 DIRAS1O95057 198 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PFKLP17858 780 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 IMPA1P29218 277 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB40BQ12829 278 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 DUSP7Q16829 419 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR152Q8TDT2 470 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CHTF18Q8WVB6 975 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MUL1Q969V5 352 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PKP4Q99569 1192 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RXFP3Q9NSD7 469 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MMP2P08253 660 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SSX9Q7RTT3 188 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TM9SF4Q92544 642 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ARMC5Q96C12 935 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2M4Q96R27 311 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF559Q9BR84 538 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM248Q9NWD8 314 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PARPBPQ9NWS1 579 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RIMS3Q9UJD0 308 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms