RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ZW10O43264 779 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 GSTM2P28161 218 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFS1P28331 727 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 EMP3P54852 163 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 IL5RAQ01344 420 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CFHR1Q03591 330 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 XAF1Q6GPH4 301 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 FAHD1Q6P587 224 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 RSC1A1Q92681 617 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 QRFPRQ96P65 431 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 EPYCQ99645 322 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 LILRA5A6NI73 299 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 M0QX08 132 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC1A7O00341 560 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 OR1F1O43749 312 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 DUX1O43812 170 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SEC14L2O76054 403 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 MT-CO3P00414 261 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PROS1P07225 676 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 HTR1AP08908 422 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK4P11802 303 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 DDCP20711 480 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 UQCRC2P22695 453 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CSF2RBP32927 897 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB15P59190 212 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK6Q00534 326 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TUBA3CQ13748 450 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 KEAP1Q14145 624 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 LCN9Q8WX39 176 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 NLNQ9BYT8 704 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 UCK1Q9HA47 277 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT84Q9NSB2 600 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL3Q9UH77 587 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 OR6C74A6NCV1 312 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PTGES3LE9PB15 166 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BMQ9 156 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TBX19O60806 448 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 OPN1SWP03999 348 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC159P0C7I6 412 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CYP4B1P13584 511 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SOAT1P35610 550 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 EPHA4P54764 986 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 NUP107P57740 925 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CSNK1G2P78368 415 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 GPLD1P80108 840 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 IFI44LQ53G44 452 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 RGMAQ96B86 450 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TAMM41Q96BW9 452 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 COG8Q96MW5 612 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM247A6NEH6 219 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 D6RAR5 112 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ATE1O95260 518 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 MATN1P21941 496 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 RRM2P31350 389 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ALDH9A1P49189 494 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1CAP62136 330 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PIGFQ07326 219 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 NATD1Q8N6N6 113 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF566Q969W8 418 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 APOL4Q9BPW4 351 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms