RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 GRM7Q14831 915 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NR0B2Q15466 257 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SYPL1Q16563 259 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SHISA5Q8N114 240 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR2L13Q8N349 312 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SMYD1Q8NB12 490 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 BBS10Q8TAM1 723 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TFAP2CQ92754 450 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GIMAP5Q96F15 307 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR7D2Q96RA2 312 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ZNF607Q96SK3 696 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 THSD1Q9NS62 852 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 USE1Q9NZ43 259 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NTMQ9P121 344 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SCOCQ9UIL1 159 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.86□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FITM1A5D6W6 292 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 DPM1O60762 260 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 THRBP10828 461 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ITGA2P17301 1181 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 FPR1P21462 350 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NT5EP21589 574 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CNR2P34972 360 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 AVPR1BP47901 424 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ARHGDIAP52565 204 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MERTKQ12866 999 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GK3PQ14409 553 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 KRT73Q86Y46 540 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CYGBQ8WWM9 190 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RDH12Q96NR8 316 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 COL21A1Q96P44 957 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GAREM1Q9H706 876 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 RUBCNLQ9H714 662 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 BLACEA4D250 179 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ADAMDEC1O15204 470 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SERPINB7O75635 380 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR2B3O76000 313 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MFN2O95140 757 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 BMP10O95393 424 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SNAP29O95721 258 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ALBP02768 609 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PNLIPP16233 465 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CD247P20963 164 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CAPGP40121 348 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 OR1E2P47887 323 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MAN2A2P49641 1150 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 EMP3P54852 163 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 HPCAP84074 193 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SLC36A3Q495N2 470 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 KRT80Q6KB66 452 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 GUSBP11Q6P575 273 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 KMT5CQ86Y97 462 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 D2HGDHQ8N465 521 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CEP76Q8TAP6 659 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ZNF675Q8TD23 568 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PROX1Q92786 737 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 PEX11GQ96HA9 241 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 ZNF347Q96SE7 839 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS2-201ENST00000299259 CAPN10Q9HC96 672 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms