RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 LZICQ8WZA0 190 aa20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 SLC35G5Q96KT7 338 aa20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 C10orf90Q96M02 699 aa20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 TGM7Q96PF1 710 aa20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 SERINC2Q96SA4 455 aa20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 KLHL3Q9UH77 587 aa20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 LILRA5A6NI73 299 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 CD247P20963 164 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 CPN2P22792 545 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 ABHD13Q7L211 337 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 THSD1Q9NS62 852 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 DAPP1Q9UN19 280 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.08■□□□□ 0.81
SOX17-201ENST00000297316 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 TNFRSF11BO00300 401 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 B3GALT2O43825 422 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 GIMD1P0DJR0 217 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 CRHBPP24387 322 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 SLC5A2P31639 672 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 PRKAG1P54619 331 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 CDH12P55289 794 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 SPIBQ01892 262 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 TNFRSF17Q02223 184 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 SHBQ15464 509 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 LTB4RQ15722 352 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 TMEM107Q6UX40 140 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 ARMC8Q8IUR7 673 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 ZNF681Q96N22 645 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 LRIT1Q9P2V4 623 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.08■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 URADA6NGE7 173 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 C5orf58C9J3I9 102 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 JRKO75564 520 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 MED26O95402 600 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 CTSKP43235 329 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 ID2Q02363 134 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 KLHL35Q6PF15 583 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 KRT84Q9NSB2 600 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 RLIMQ9NVW2 624 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 MFN2O95140 757 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 XCR1P46094 333 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 OR1D5P58170 312 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 SLC30A8Q8IWU4 369 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 TMEM52Q8NDY8 209 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 DOK4Q8TEW6 326 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 WFDC6Q9BQY6 131 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 IER2Q9BTL4 223 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 UCK1Q9HA47 277 aa20.07■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 FAM227AF5H4B4 570 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 SGK494L7N484 410 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 IFNA14P01570 189 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 PMS2P3Q13401 168 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 KAT2AQ92830 837 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.06■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 ADAMDEC1O15204 470 aa20.05■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 SLC28A2O43868 658 aa20.05■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 MATN1P21941 496 aa20.05■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 HOXA6P31267 233 aa20.05■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SOX17-201ENST00000297316 PIGFQ07326 219 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms