RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 KATNB1Q9BVA0 655 aa23.88■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.88■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 M0R3H8 397 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 STK25O00506 426 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 MOSPD3O75425 235 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 APOL3O95236 402 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ADH1AP07327 375 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 GIPRP48546 466 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 KLHL22Q53GT1 634 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZER1Q7Z7L7 766 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SYT14Q8NB59 555 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ANKRA2Q9H9E1 313 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZSCAN32Q9NX65 697 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 TOR4AQ9NXH8 423 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 FAM25AB3EWG3 89 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 FAM25CB3EWG5 89 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 FAM25GB3EWG6 89 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SPINT1O43278 529 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 NDUFB5O43674 189 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 NR2F6P10588 404 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 COX10Q12887 443 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SYPL1Q16563 259 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF628Q5EBL2 1059 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 C3orf38Q5JPI3 329 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 LCN1P1Q5VSP4 162 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 COMTD1Q86VU5 262 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 GATAD2BQ8WXI9 593 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SMPDL3AQ92484 453 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 TM9SF4Q92544 642 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 PPP1R16AQ96I34 528 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ACAT2Q9BWD1 397 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 NEUROD4Q9HD90 331 aa23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 PI15O43692 258 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CXCL14O95715 111 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 METAP1P53582 386 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF77Q15935 545 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF547Q8IVP9 402 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 KRT78Q8N1N4 520 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 AP3S1Q92572 193 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 FNDC11Q9BVV2 318 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 A0A1W2PRQ8 180 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SLC30A4O14863 429 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 EPHX1P07099 455 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.413e-6■■■■□ 20.6
CTBP1-201ENST00000290921 ACADLP28330 430 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 GAS1P54826 345 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.414e-8■■■■□ 26.1
CTBP1-201ENST00000290921 GALK2Q01415 458 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CHRNEQ04844 493 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SNAPC1Q16533 368 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 UAP1L1Q3KQV9 507 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CD300LDQ6UXZ3 194 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF730Q6ZMV8 503 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 PDZD3Q86UT5 571 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 OR4K5Q8NGD3 323 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 OR52P1PQ8NH57 321 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 FGF11Q92914 225 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 F2RL3Q96RI0 385 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 TM9SF2Q99805 663 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SERHL2Q9H4I8 314 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 FBXW2Q9UKT8 454 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 PLAGL1Q9UM63 463 aa23.86■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 NOTOA8MTQ0 251 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 HLA-DMAP28067 261 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CAV3P56539 151 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 EFNB1P98172 346 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CDK5Q00535 292 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 IQCHQ86VS3 1027 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 FAM129CQ86XR2 697 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 OR7G1Q8NGA0 311 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 GRPEL2Q8TAA5 225 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CAPNS2Q96L46 248 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 GPA33Q99795 319 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 OR6C70A6NIJ9 312 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 OR12D1P0DN82 309 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 APEX1P27695 318 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 CAMK2BQ13554 666 aa23.85■■□□□ 1.41
CTBP1-201ENST00000290921 TPBGQ13641 420 aa23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms