RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288050.8

PDPR-201, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 9,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-201ENST00000288050 COL20A1Q9P218 1284 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 AGLP35573 1532 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 F8VP50 259 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SUSD5O60279 629 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TLR5O60602 858 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 CDK14O94921 469 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 KCNK2O95069 426 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ELNP15502 786 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ARL2P36404 184 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PBX2P40425 430 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 GSK3AP49840 483 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 GPR21Q99679 349 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SOX2P48431 317 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TNK1Q13470 666 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 GK3PQ14409 553 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 OR8K5Q8NH50 307 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 CD84Q9UIB8 345 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 GABARAPH6UMI1 98 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ABCB7O75027 752 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 GABARAPO95166 117 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SCGB1A1P11684 91 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 LRRC38Q5VT99 294 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 OR2M3Q8NG83 312 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ABCG5Q9H222 651 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SLC22A5O76082 557 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 LGMNQ99538 433 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SRRQ9GZT4 340 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 UTS2RQ9UKP6 389 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 HES2Q9Y543 173 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 STBD1O95210 358 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PBX3P40426 434 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PITPNBP48739 271 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PDGFRLQ15198 375 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.898e-6■■■■■ 32.8
PDPR-201ENST00000288050 FJX1Q86VR8 437 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 A0A1W2PQ67 120 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TGOLN2O43493 480 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 UNC93AQ86WB7 457 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TMEM234Q8WY98 164 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 FBXW5Q969U6 566 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TRBC2A0A5B9 178 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PPP2CBP62714 309 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 CARD17Q5XLA6 110 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 ASB9Q96DX5 294 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SLIT1O75093 1534 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 PEAK1Q9H792 1746 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 GJB6O95452 261 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 MAS1P04201 325 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 RANP62826 216 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 KDM1BQ8NB78 822 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 MR1Q95460 341 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 SGK3Q96BR1 496 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 POLHQ9Y253 713 aa9.49□□□□□ -0.89
PDPR-201ENST00000288050 CSF1P09603 554 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms