RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266085.6

TIMP3-201, Transcript of TIMP metallopeptidase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMP3, Length 4,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3-201ENST00000266085 GPR143P51810 404 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 ARFRP1Q13795 201 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 TAMM41Q96BW9 452 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 CHFRQ96EP1 664 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 SMOXQ9NWM0 555 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 A0A0G2JNG1 304 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 A0A1B0GVT2 93 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 PRSS38A1L453 326 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 C1orf105O95561 183 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 KIR2DS3Q14952 304 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 KIR2DS5Q14953 304 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 XKR5Q6UX68 686 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 GPR149Q86SP6 731 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 ITIH1P19827 911 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 CERS1P27544 350 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 IST1P53990 364 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 MLLT10P55197 1068 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 RNF121Q9H920 327 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 H3BNC9 293 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 SLC15A1P46059 708 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 OR3A3P47888 321 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 OR3A2P47893 321 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 CDKL1Q00532 357 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 PMS2P3Q13401 168 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 CLCA4Q14CN2 919 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 EGLN2Q96KS0 407 aa14.65□□□□□ -0.06
TIMP3-201ENST00000266085 A0A0G2JPF8 293 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 CLPXO76031 633 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 HTR1AP08908 422 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 DCKP27707 260 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 CD38P28907 300 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 TMEM225Q6GV28 225 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 ANTXRLA6NF34 631 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 SOCS2O14508 198 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 DNAJB5O75953 348 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 GSTM2P28161 218 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 CD6P30203 668 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 VEZF1Q14119 521 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 ZNF675Q8TD23 568 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 NETO1Q8TDF5 533 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 NSMAFQ92636 917 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 ARNTLO00327 626 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 SYPP08247 313 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 PSKH1P11801 424 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 NFATC4Q14934 902 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 SPATC1Q76KD6 591 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 ASB16Q96NS5 453 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 LPAR4Q99677 370 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 KLF15Q9UIH9 416 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 SOBPA7XYQ1 873 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 C11orf98E9PRG8 122 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 J3QRK9 145 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 PRAMEF10O60809 474 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 SEMA3DO95025 777 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 ADAP00813 363 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 F3P13726 295 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 DDCP20711 480 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 HLCSP50747 726 aa14.64□□□□□ -0.07
TIMP3-201ENST00000266085 VBP1P61758 197 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms