RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 DDCP20711 480 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 BCL6P41182 706 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 MC3RP41968 323 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 UGT2B15P54855 530 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CDK3Q00526 305 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SLAMF1Q13291 335 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PDE7AQ13946 482 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 KCNC3Q14003 757 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 GINS1Q14691 196 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 GAB4Q2WGN9 574 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TTC23LQ6PF05 361 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 AMER2Q8N7J2 671 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 OR2L2Q8NH16 312 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SMPDL3AQ92484 453 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SUSD6Q92537 303 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 FGF13Q92913 245 aa8.19□□□□□ -1.1
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GINS1-201ENST00000262460 UCK2Q9BZX2 261 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CLN6Q9NWW5 311 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 DPP7Q9UHL4 492 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PR48 441 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 ZAR1LA6NP61 321 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 GNB5O14775 395 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 H1F0P07305 194 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CHRNEQ04844 493 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 FUT5Q11128 374 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 USP30Q70CQ3 517 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.19□□□□□ -1.1
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GINS1-201ENST00000262460 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 BBS4Q96RK4 519 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 MS4A8Q9BY19 250 aa8.19□□□□□ -1.1
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GINS1-201ENST00000262460 STARD5Q9NSY2 213 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PI15O43692 258 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 LALBAP00709 142 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PRNPP04156 253 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 UQCRC2P22695 453 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 DRD3P35462 400 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 BMPR1AP36894 532 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 COPZ1P61923 177 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 SNAPC1Q16533 368 aa8.18□□□□□ -1.1
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GINS1-201ENST00000262460 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PNCKQ6P2M8 343 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CASP12Q6UXS9 341 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 USP43Q70EL4 1123 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 KIF18BQ86Y91 864 aa8.18□□□□□ -1.1
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GINS1-201ENST00000262460 PGBD3Q8N328 593 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PATE1Q8WXA2 126 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 S100ZQ8WXG8 99 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 REPS1Q96D71 796 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PLXNA2O75051 1894 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 PTPRSQ13332 1948 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 TMEM221A6NGB7 291 aa8.18□□□□□ -1.1
GINS1-201ENST00000262460 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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