RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 MYBPC1Q00872 1141 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 FHL3Q13643 280 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 PRSS36Q5K4E3 855 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ULK3Q6PHR2 472 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 UNC93AQ86WB7 457 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 C10orf107Q8IVU9 208 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 OSER1Q9NX31 292 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 MEMO1Q9Y316 297 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 GRIN2DO15399 1336 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CLUHO75153 1309 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 DHHO43323 396 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 MAGEC1O60732 1142 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 UGT2B11O75310 529 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CABYRO75952 493 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SPDEFO95238 335 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 PIGNO95427 931 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CCNE2O96020 404 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 FTH1P02794 183 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CYP1A2P05177 515 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 NUDT17P0C025 328 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 MAGP20916 626 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 GATA3P23771 443 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SDC2P34741 201 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ELK3P41970 407 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SLC9A3P48764 834 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ENTPD1P49961 510 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 PDX1P52945 283 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 BTN3A2P78410 334 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 GRB14Q14449 540 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ZBTB6Q15916 424 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SSX2Q16385 188 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 MTX3Q5HYI7 312 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 TRILQ7L0X0 811 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SYVN1Q86TM6 617 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ANKRD46Q86W74 232 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 RAB43Q86YS6 212 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 L3MBTL4Q8NA19 623 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SEMA4DQ92854 862 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 HSFY1Q96LI6 401 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 S1PR5Q9H228 398 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CPVLQ9H3G5 476 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CISHQ9NSE2 258 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 IFT52Q9Y366 437 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 GCC2Q8IWJ2 1684 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 M0QZ24 198 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 LRRTM2O43300 516 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 B4GAT1O43505 415 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 RLN2P04090 185 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 IDO1P14902 403 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 S1PR1P21453 382 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CD9P21926 228 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 IST1P53990 364 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 EFEMP1Q12805 493 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 PON2Q15165 354 aa3.47□□□□□ -1.85
LATS1-201ENST00000253339 Q3ZCU0 254 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms