RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tram2Q924Z5 370 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clcc1Q99LI2 539 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myl9Q9CQ19 172 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp5f1Q9CQQ7 256 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BlvraQ9CY64 295 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plekhj1Q9D240 164 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd7Q9D504 279 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam96aQ9DCL2 160 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tlr1Q9EPQ1 795 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nusap1Q9ERH4 427 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alyref2Q9JJW6 218 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ReckQ9Z0J1 971 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcaf4A0A1Y7VNZ0 532 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr742A2RTP5 311 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt28A6BLY7 462 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtprhE9Q0N2 971 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm17026K7N6Z0 213 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Reps1O54916 795 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pou3f2P31360 445 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zic1P46684 447 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtpaP58389 323 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sox4Q06831 440 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gsk3aQ2NL51 490 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpc5osQ3UHV4 110 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc106Q3ULM0 279 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bpifb1Q61114 474 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp1b1Q64429 543 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas2r117Q7M715 330 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hamp2Q80T19 83 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 E330021D16RikQ8BW45 371 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ska3Q8C263 411 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tab1Q8CF89 502 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gatad2aQ8CHY6 629 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtrf1Q8K126 446 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wfikkn1Q8R0S6 552 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cops8Q8VBV7 209 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr693Q8VF89 316 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr444Q8VFS6 310 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1414Q8VGU5 312 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp2r2dQ925E7 453 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr146Q99LE2 333 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspa14Q99M31 509 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppil1Q9D0W5 166 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf207Q9JMD0 495 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itgb6Q9Z0T9 787 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnd3Q9Z0V1 655 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uba2Q9Z1F9 638 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1032A2ATE5 310 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930444G20RikD3Z741 495 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr619E9PV95 320 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3149E9PW52 257 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr891E9Q843 316 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8362K7N6Y6 257 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtgdsO09114 189 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alx3O70137 343 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01631 113 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubl4aP21126 157 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ThpoP40226 356 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Etv1P41164 477 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fabp7P51880 132 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dppa5bP85965 119 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bod1Q5SQY2 173 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spin1Q61142 262 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tlx2Q61663 284 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ostf1Q62422 215 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtprjQ64455 1238 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapre3Q6PER3 281 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AptxQ7TQC5 342 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lamp3Q7TST5 411 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc39a9Q8BFU1 308 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc15a3Q8BPX9 578 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Yipf6Q8BR70 236 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SprnQ8BWU1 147 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ExogQ8C163 368 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa0513Q8R0A7 407 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf121Q8R1Z9 327 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr633Q8VF02 312 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EdaraddQ8VHX2 208 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc3a1Q91WV7 685 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcbld2Q91ZV3 769 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh3bp4Q921I6 962 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oosp1Q925U0 202 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm26657Q9CVR1 127 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Etv5Q9CXC9 510 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl19Q9D338 292 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tvp23bQ9D8T4 205 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr88Q9EPB7 384 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms