RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		A6NJY4	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MPZL2	O60487	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LRIG2	O94898	1065 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC34A2	O95436	690 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CDH1	P12830	882 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RHOB	P62745	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DAW1	Q8N136	415 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RGMA	Q96B86	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PLIN3	O60664	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	STK16	O75716	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EPCAM	P16422	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RAB6A	P20340	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CSK	P41240	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DPT	Q07507	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GRIK2	Q13002	908 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	IL11RA	Q14626	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		A0A0U1RQK1	487 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		A8MU76	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DIRAS1	O95057	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HEXA	P06865	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ANXA8	P13928	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ARR3	P36575	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HTR3A	P46098	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PRPS1	P60891	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RAC1	P63000	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CCZ1B	P86790	482 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	NPY5R	Q15761	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RASD2	Q96D21	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SARG	Q9BW04	601 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CYP17A1	P05093	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MTHFD2	P13995	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EMP3	P54852	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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