RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CASP10	Q92851	521 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NCLN	Q969V3	563 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MUL1	Q969V5	352 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NODAL	Q96S42	347 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATRX	P46100	2492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A1W2PPW3	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525		M0QZ92	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NR5A2	O00482	541 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EI24	O14681	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MPZL2	O60487	215 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VPS26A	O75436	327 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NDST3	O95803	873 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APOA1	P02647	267 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHRNA1	P02708	482 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERPINF2	P08697	491 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRPS2	P11908	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AKR1A1	P14550	325 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRPH2	P23942	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LMO2	P25791	158 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NDUFS1	P28331	727 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTGER3	P43115	390 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEA2	P43356	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEA11	P43364	429 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STT3A	P46977	705 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NRIP1	P48552	1158 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT6C	P48668	564 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRPC1	P48995	793 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCYT1A	P49585	367 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSPY1	Q01534	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRKCD	Q05655	676 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GAB1	Q13480	694 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PEX6	Q13608	980 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POU6F1	Q14863	301 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SHB	Q15464	509 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF691	Q5VV52	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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