RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TRAM1L1Q8N609 369 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 NAT14Q8WUY8 206 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM159Q96B96 161 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TRABDQ9H4I3 376 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 IL26Q9NPH9 171 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HACD3Q9P035 362 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PISDQ9UG56 409 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ITPR2Q14571 2701 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 C2orf81A6NN90 581 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HSPB2A8KAH6 182 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TARM1B6A8C7 271 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PSMD3O43242 534 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 UGT1A9O60656 530 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TNFP01375 233 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CD63P08962 238 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS56P0CW18 603 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CTSEP14091 401 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 UGT1A6P19224 532 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TFEBP19484 476 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 UGT1A1P22309 533 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 UGT1A4P22310 534 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 KELP23276 732 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CD82P27701 267 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TEAD1P28347 426 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 UGT1A3P35503 534 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FNTAP49354 379 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CRADDP78560 199 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CDH17Q12864 832 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 KCNJ11Q14654 390 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HSPB2Q16082 182 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF534Q76KX8 674 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00523Q86TU6 105 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 GLYATL1Q969I3 302 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 VPS33AQ96AX1 596 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC45Q96CN5 670 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TMCO6Q96DC7 493 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 VMP1Q96GC9 406 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM68Q96MH6 324 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 OR2AG1Q9H205 316 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.27□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 OR51F1A6NGY5 319 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 B4DGG1 531 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 AVILO75366 819 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 IVLP07476 585 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 PCNAP12004 261 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 ITIH1P19827 911 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 TPSB2P20231 275 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 XIAPP98170 497 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 C2orf54Q08AI8 447 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 PEX6Q13608 980 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 ELOCQ15369 112 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1R7Q15435 360 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 TPSAB1Q15661 275 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms