RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 MDS2Q8NDY4 140 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SGCZQ96LD1 299 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 BBS4Q96RK4 519 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LUZP4Q9P127 313 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PRODH2Q9UF12 536 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR91A4D1P6 747 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SP1P08047 785 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 EDN3P14138 238 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC1A6P48664 564 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 HK2P52789 917 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 DCAF7P61962 342 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FUT7Q11130 342 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP4K2Q12851 820 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 STX3Q13277 289 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NATD1Q8N6N6 113 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF675Q8TD23 568 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FAR1Q8WVX9 515 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TP53INP1Q96A56 240 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TLCD1Q96CP7 247 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MTERF3Q96E29 417 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SCMH1Q96GD3 660 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NPAS2Q99743 824 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 EBPLQ9BY08 206 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM4Q9C037 500 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 OLAHQ9NV23 265 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PIP5K1BO14986 540 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NME2P1O60361 137 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 OR2J2O76002 312 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 IFI6P09912 130 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LINC00032P0C843 101 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PRPS2P11908 318 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NME2P22392 152 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC37A1P57057 533 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNTL6Q49A17 601 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RTL4Q6ZR62 310 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FCRL1Q96LA6 429 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RASL10BQ96S79 203 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 OR10A5Q9H207 317 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CLMPQ9H6B4 373 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 WWP2O00308 870 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 F10P00742 488 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 HPCAL1P37235 193 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RBPJQ06330 500 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA0040Q15053 153 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CEBPEQ15744 281 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 XKR7Q5GH72 579 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PIGGQ5H8A4 983 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SPINK14Q6IE38 97 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 Q6ZSR9 355 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 AGR3Q8TD06 166 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 GRHL3Q8TE85 626 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 C19orf60Q96EN9 201 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms