RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 APOPT1Q96IL0 206 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KIFC1Q9BW19 673 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 METTL9Q9H1A3 318 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CTSFQ9UBX1 484 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LRRC53A6NM62 1247 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 VILLO15195 856 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MFN2O95140 757 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SEMA4FO95754 770 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LIPFP07098 398 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CD63P08962 238 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NT5EP21589 574 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CHRNA3P32297 505 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 VHLP40337 213 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ALDH3B2P48448 385 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MEOX2P50222 304 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RAB13P51153 203 aa7.38□□□□□ -1.23
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LMO3-212ENST00000535535 PRPS1P60891 318 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TNNC1P63316 161 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LY6DQ14210 128 aa7.38□□□□□ -1.23
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LMO3-212ENST00000535535 TMEM215Q68D42 235 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.38□□□□□ -1.23
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LMO3-212ENST00000535535 TTC7BQ86TV6 843 aa7.38□□□□□ -1.23
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LMO3-212ENST00000535535 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.38□□□□□ -1.23
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LMO3-212ENST00000535535 OR2T3Q8NH03 318 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SAP25Q8TEE9 199 aa7.38□□□□□ -1.23
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LMO3-212ENST00000535535 NT5C3BQ969T7 300 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LGMNQ99538 433 aa7.38□□□□□ -1.23
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LMO3-212ENST00000535535 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 OSER1Q9NX31 292 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 COX11Q9Y6N1 276 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PRV1 198 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MDM4O15151 490 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SLC31A2O15432 143 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SEC14L5O43304 696 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DCTN3O75935 186 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CLPXO76031 633 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZFPL1O95159 310 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 VNN1O95497 513 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 IGHV4-34P06331 123 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CRYGCP07315 174 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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