RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 VPS33AQ96AX1 596 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 C14orf79Q96F83 325 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 KCNK16Q96T55 309 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 PAFAH2Q99487 392 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 CCT7Q99832 543 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 SPATC1LQ9H0A9 340 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 LY9Q9HBG7 655 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 PKD2L2Q9NZM6 624 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF148Q9UQR1 794 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ZBED9Q6R2W3 1325 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 MEIS2O14770 477 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 RASGRF2O14827 1237 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 SPAG6O75602 509 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 TOMM70O94826 608 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 HMOX1P09601 288 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 STAG3L3P0CL85 134 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC192P0DO97 292 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 RALBP11234 206 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF32P17041 273 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 EVI2BP34910 448 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 HTR2BP41595 481 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 CBX5P45973 191 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 OR1G1P47890 313 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 SLC9A3P48764 834 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 S100A12P80511 92 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ELP6Q0PNE2 266 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 SYT14P1Q58G82 188 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 C1orf185Q5T7R7 199 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 GPR142Q7Z601 462 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 MMD2Q8IY49 270 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 FIBINQ8TAL6 211 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 MAIP1Q8WWC4 291 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-220ENST00000531466 SLC35B4Q969S0 331 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 OPTNQ96CV9 577 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ERO1AQ96HE7 468 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 CGREF1Q99674 301 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 CARD6Q9BX69 1037 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 PINK1Q9BXM7 581 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 TRIM4Q9C037 500 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 OPA3Q9H6K4 179 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 PARVBQ9HBI1 364 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-220ENST00000531466 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.05□□□□□ -1.92
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