RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 GALNSP34059 522 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 PIK3CBP42338 1070 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ARFIP1P53367 373 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CBLBQ13191 982 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 RPS6KA2Q15349 733 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM64Q6YI46 380 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 PACS2Q86VP3 889 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 RNF175Q8N4F7 328 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 EXT2Q93063 718 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 RILPQ96NA2 401 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TRIB1Q96RU8 372 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CALHM2Q9HA72 323 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 SNX15Q9NRS6 342 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 JKAMPQ9P055 326 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 NCKAP5O14513 1909 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 K7EPI3 171 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 PLPP1O14494 284 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 IL18BPO95998 194 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CLPSP04118 112 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 SLC35E2P0CK97 266 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 BMP7P18075 431 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 MASP1P48740 699 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 FBXW4P57775 412 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 BICRALQ6AI39 1079 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CDKL2Q92772 493 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 GPR22Q99680 433 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ALG9Q9H6U8 611 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 OPTCQ9UBM4 332 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ASB4Q9Y574 426 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 JMJD1CQ15652 2540 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PR48 441 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 GLOD5A6NK44 160 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CLCA1A8K7I4 914 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 INHBBP09529 407 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 EPB42P16452 691 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CD53P19397 219 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CASP3P42574 277 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 RAB10P61026 200 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 DCAF7P61962 342 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ISCA2Q86U28 154 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 RBBP8Q99708 897 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 CPNE1Q99829 537 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 WDR41Q9HAD4 459 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 TMPRSS11DO60235 418 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 HRGP04196 525 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 NR2F6P10588 404 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 SSTR1P30872 391 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 SSTR4P31391 388 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-210ENST00000527027 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms