RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520489.5

BIN3-208, Transcript of bridging integrator 3, humanhuman

TSL 2

Gene BIN3, Length 3,589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3-208ENST00000520489 OR4M1Q8NGD0 313 aa10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 WDR48Q8TAF3 677 aa10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TRIM63Q969Q1 353 aa10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 CMTM3Q96MX0 182 aa10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TCF25Q9BQ70 676 aa10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 BBS2Q9BXC9 721 aa10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 PRODHO43272 600 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 LIMS3P0CW19 117 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 LIMS4P0CW20 117 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 GKP32189 559 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 THBS2P35442 1172 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ETV5P41161 510 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ETV1P50549 477 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ARPC4P59998 168 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TBPL1P62380 186 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 HGDQ93099 445 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 PRRC1Q96M27 445 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ABCG8Q9H221 673 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 FAM25AB3EWG3 89 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 FAM25CB3EWG5 89 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 FAM25GB3EWG6 89 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 PRKYO43930 277 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TMCC2O75069 709 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 CTSLP07711 333 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 FAPQ12884 760 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SLAMF1Q13291 335 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 BBS10Q8TAM1 723 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 PPCDCQ96CD2 204 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 NELL2Q99435 816 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 OR5K3A6NET4 321 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ALOX12P18054 663 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SLC6A1P30531 599 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 BTCP35070 178 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 HSD17B2P37059 387 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ABATP80404 500 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 DHODHQ02127 395 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 GPR162Q16538 588 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 PXKQ7Z7A4 578 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 AP3S1Q92572 193 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 DTD2Q96FN9 168 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 A0A1W2PPV9 198 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 PLPP1O14494 284 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 MOSPD3O75425 235 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 GNRH1P01148 92 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 CISD3P0C7P0 127 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 OMPP47874 163 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 NUDT6P53370 316 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 TMEM215Q68D42 235 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.98□□□□□ -0.81
BIN3-208ENST00000520489 OR2L2Q8NH16 312 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms