RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MED17Q9NVC6 651 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEC14L4Q9UDX3 406 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CIDEBQ9UHD4 219 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC13A4Q9UKG4 626 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C7orf66A4D0T2 115 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VGLL3A8MV65 326 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 E5RGE8 158 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADAMDEC1O15204 470 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 P2RX6O15547 441 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CTDNEP1O95476 244 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PFKFB1P16118 471 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UQCRC2P22695 453 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WARSP23381 471 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OTX2P32243 289 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC1A3P43003 542 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRAPPC10P48553 1259 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LCP2Q13094 533 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPA1Q15181 289 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SYPL1Q16563 259 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC57Q2TAC2 916 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COX19Q49B96 90 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SUSD4Q5VX71 490 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HCP5Q6MZN7 132 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF730Q6ZMV8 503 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLFN11Q7Z7L1 901 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM110Q86TL2 294 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RAB3CQ96E17 227 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C16orf58Q96GQ5 468 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CEP170P1Q96L14 293 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FEVQ99581 238 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CPNE1Q99829 537 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM173AQ9BQD7 235 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WWP1Q9H0M0 922 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DPEP2Q9H4A9 486 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NSG2Q9Y328 171 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SCN2AQ99250 2005 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COL7A1Q02388 2944 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A0J9YXY3 114 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 I3L1I5 382 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 K7N7A8 449 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OVOL1O14753 267 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PGRMC2O15173 223 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 B4GALT5O43286 388 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUDT14O95848 222 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LINGO3P0C6S8 592 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STAG3L1P0CL83 205 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGFBP5P24593 272 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UGT1A5P35504 534 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR1D4P47884 311 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALDH3B2P48448 385 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FHITP49789 147 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRT31Q15323 416 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD226Q15762 336 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAP9Q49MG5 647 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MS4A13Q5J8X5 152 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR2B11Q5JQS5 317 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF165Q6ZSG1 346 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPP1R27Q86WC6 154 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WDTC1Q8N5D0 677 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UBTD2Q8WUN7 234 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NEIL2Q969S2 332 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAFAH2Q99487 392 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 S100A14Q9HCY8 104 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ESM1Q9NQ30 184 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PIGVQ9NUD9 493 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TAS2R16Q9NYV7 291 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WDR35Q9P2L0 1181 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FZR1Q9UM11 496 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DUSP12Q9UNI6 340 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPY2A6NKD2 308 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF732B4DXR9 585 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C11orf94C9JXX5 98 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 B4GAT1O43505 415 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALPIP09923 528 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPY3P0CV98 308 aa-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms