RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 PDE7AQ13946 482 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF111Q6ZNA4 994 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC00696Q6ZRV3 163 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 VWA5B2Q8N398 1253 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF2BQ8N4N8 673 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 TEX19Q8NA77 164 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 NUBPLQ8TB37 319 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 ACTRT2Q8TDY3 377 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 HAS2Q92819 552 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP6V1HQ9UI12 483 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVK-19Q9WJR5 959 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 USH1CQ9Y6N9 552 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 SPTA1P02549 2419 aa24.95■■□□□ 1.59
SH3BP2-212ENST00000508338 MYO1GB0I1T2 1018 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 IFI6P09912 130 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC29A4Q7RTT9 530 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFP28Q8NHY6 868 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ANAPC2Q9UJX6 822 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 COL6A6A6NMZ7 2263 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PDGFAP04085 211 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 G6PDP11413 515 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CASRP41180 1078 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CLDN8P56748 225 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 MLF1P58340 268 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF4P78317 190 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ARG2P78540 354 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ACAD11Q709F0 780 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC116Q8IYX3 515 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 HORMAD2Q8N7B1 307 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP70Q8NHQ1 597 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 BRINP2Q9C0B6 783 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CDCP1Q9H5V8 836 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ATRXP46100 2492 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 K7EM74 188 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PDPK1O15530 556 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 AKAP10O43572 662 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 LRATO95237 230 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 EPHA3P29320 983 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC37A1P57057 533 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PTGR1Q14914 329 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF750Q32MQ0 723 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CLHC1Q8NHS4 586 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 STON2Q8WXE9 905 aa24.93■■□□□ 1.58
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SH3BP2-212ENST00000508338 CTHRC1Q96CG8 243 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 MAT2BQ9NZL9 334 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 MYOTQ9UBF9 498 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PS29 197 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 GABRR3A8MPY1 467 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 NFATC3Q12968 1075 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 TLR1Q15399 786 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 MPEG1Q2M385 716 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CPTPQ5TA50 214 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 EPGNQ6UW88 154 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SUN3Q8TAQ9 357 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PNPLA2Q96AD5 504 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10A5Q9H207 317 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PRODH2Q9UF12 536 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF639Q9UID6 485 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5H15A6NDH6 313 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF195O14628 629 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PRAMEF2O60811 474 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 DIAPH2O60879 1101 aa24.91■■□□□ 1.58
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SH3BP2-212ENST00000508338 DPY19L1Q2PZI1 675 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF628Q5EBL2 1059 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 NXNQ6DKJ4 435 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 Q6ZS92 163 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM47EQ6ZV65 393 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CAMKMTQ7Z624 323 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 BEST3Q8N1M1 668 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC15A4Q8N697 577 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 AMDHD1Q96NU7 426 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 DPY30Q9C005 99 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC134Q9H6E4 229 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A087WV62 115 aa24.9■■□□□ 1.58
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