RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLHL1	Q9NR64	748 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRFN1	Q9P244	771 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNAJC13	O75165	2243 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLE	Q07864	2286 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	WWP2	O00308	870 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FCHO1	O14526	889 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR2J2	O76002	312 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLPS	P04118	112 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FGF4	P08620	206 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPM	P14384	443 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PMP22	Q01453	160 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA0040	Q15053	153 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR2T11	Q8NH01	316 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	AGR3	Q8TD06	166 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIT1	Q92963	219 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCMH1	Q96GD3	660 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXL20	Q96IG2	436 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYOT	Q9UBF9	498 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC28A1	O00337	649 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TM9SF1	O15321	606 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITM2A	O43736	263 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC00032	P0C843	101 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SSTR4	P31391	388 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALNS	P34059	522 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYB561	P49447	251 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	HLCS	P50747	726 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CASP8	Q14790	479 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR8K3	Q8NH51	312 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAR1	Q8WVX9	515 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLHL29	Q96CT2	875 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF681	Q96N22	645 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DYRK3	O43781	588 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEC22B	O75396	215 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	WISP2	O76076	250 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZWINT	O95229	277 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RASAL1	O95294	804 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SP1	P08047	785 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYZAP	P0CAP1	466 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	DRD2	P14416	443 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CD46	P15529	392 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	NT5E	P21589	574 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRPH2	P23942	346 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SOX18	P35713	384 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC37A1	P57057	533 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	C2orf80	Q0P641	193 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	MGAT2	Q10469	447 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM156	Q8N614	296 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	ART5	Q96L15	291 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	RASL10B	Q96S79	203 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		14.67	□□□□□ -0.06

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