RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC5A8	Q8N695	610 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FAR1	Q8WVX9	515 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SMPDL3A	Q92484	453 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB8B	Q92930	207 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	REPS1	Q96D71	796 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C12orf66	Q96MD2	445 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	COG8	Q96MW5	612 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DOHH	Q9BU89	302 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CAPN10	Q9HC96	672 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	THADA	Q6YHU6	1953 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM227A	F5H4B4	570 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HAT1	O14929	419 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PGRMC2	O15173	223 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1F1	O43749	312 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DPM1	O60762	260 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	E2F6	O75461	281 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	JRK	O75564	520 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SEMA3D	O95025	777 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FKBP9	O95302	570 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C9	P02748	559 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	INHBB	P09529	407 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PCSK2	P16519	638 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GABRB1	P18505	474 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DDC	P20711	480 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	UQCRC2	P22695	453 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NR4A1	P22736	598 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	IGFBP5	P24593	272 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GSTM2	P28161	218 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HTR1B	P28222	390 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SOAT1	P35610	550 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SOX18	P35713	384 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT20	P35900	424 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CTSK	P43235	329 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	XCR1	P46094	333 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RABIF	P47224	123 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ENTPD1	P49961	510 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CCR8	P51685	355 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA2G16	P53816	162 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LIM2	P55344	173 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NXPH1	P58417	271 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GABARAPL2	P60520	117 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	YPEL5	P62699	121 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SELENOW	P63302	87 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CDK6	Q00534	326 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MVK	Q03426	396 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FUT5	Q11128	374 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf61	Q13536	156 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP7	Q14244	749 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FZD2	Q14332	565 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SPCS2	Q15005	226 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RPE65	Q16518	533 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DUSP7	Q16829	419 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	STPG1	Q5TH74	334 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	BROX	Q5VW32	411 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		5.48	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	IQCH	Q86VS3	1027 aa		5.48	□□□□□ -1.53

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