RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 U3KQV3 271 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 AFF2P51816 1311 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 F8WDY8 70 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 K7EPI3 171 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS8O00214 317 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN3O15551 220 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SCGB2A1O75556 95 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 UGT1A4P22310 534 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 HKDC1Q2TB90 917 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF329Q86UD4 541 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CERS5Q8N5B7 392 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 BCORP1Q8N888 145 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FICDQ9BVA6 458 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 IGLON5A6NGN9 336 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 RRASP10301 218 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SELEP16581 610 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 SRPXP78539 464 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 AMZ2Q86W34 360 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 KCNMB4Q86W47 210 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MISPQ8IVT2 679 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 BANPQ8N9N5 519 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NLNQ9BYT8 704 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DEPPQ9NTK1 212 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF724A8MTY0 619 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM12O43184 909 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 IDH3BO43837 385 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SMPD2O60906 423 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TOM1L1O75674 476 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 HERVK_113P63132 956 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-8P63133 956 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 EMC2Q15006 297 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF146Q15072 292 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 MUC21Q5SSG8 566 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 GPBP1Q86WP2 473 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CARM1Q86X55 608 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 RCHY1Q96PM5 261 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NT5DC2Q9H857 520 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF749O43361 778 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZG16O60844 167 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 IFNB1P01574 187 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN6P29350 595 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 HSF2Q03933 536 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NFATC2Q13469 925 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ENPP2Q13822 863 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC51Q96ER9 411 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00479Q96M42 142 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TSGA13Q96PP4 275 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 Q9HAA7 133 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.38□□□□□ -1.39
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