RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 GPS1Q13098 491 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SP140Q13342 867 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NAE1Q13564 534 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HERC3Q15034 1050 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1C1Q15619 314 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NSDHLQ15738 373 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP1B1Q16678 543 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PHKG1Q16816 387 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SFT2D3Q587I9 215 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CASC4Q6P4E1 433 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 AGTRAPQ6RW13 159 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LCTLQ6UWM7 567 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 Q6ZPA2 131 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ADCK2Q7Z695 626 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ASPGQ86U10 573 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SPC24Q8NBT2 197 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OR56A3Q8NH54 315 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SMIM10Q96HG1 83 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4K3Q96R72 315 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OLFM1Q99784 485 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LDAHQ9H6V9 325 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNK13Q9HB14 408 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKHQ9HCJ1 492 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HCN3Q9P1Z3 774 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TINAGQ9UJW2 476 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TRBC2A0A5B9 178 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CTAGE15A4D2H0 777 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GABRR3A8MPY1 467 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NPIPA5E9PKD4 350 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CHST10O43529 356 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN14O95500 239 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 AHSGP02765 367 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FHP07954 510 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CDH1P12830 882 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 COX6B1P14854 86 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CCND1P24385 295 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MTNR1BP49286 362 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS41P49754 854 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR143P51810 404 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SMSP52788 366 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TERF1P54274 439 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CASP6P55212 293 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MLF1P58340 268 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP10-9P60411 292 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 DUPD1Q68J44 220 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNT7Q86SF2 657 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CTAGE6Q86UF2 777 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C17orf64Q86WR6 236 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 DOLPP1Q86YN1 238 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CNTN4Q8IWV2 1026 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC5A8Q8N695 610 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM58Q8NG06 486 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NT5CQ8TCD5 201 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 STON2Q8WXE9 905 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TSLPQ969D9 159 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXL8Q96CD0 374 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C14orf79Q96F83 325 aa5.93□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SNF8Q96H20 258 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms