RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 OR4A15Q8NGL6 344 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SCRN2Q96FV2 425 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF558Q96NG5 402 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 KCTD5Q9NXV2 234 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TMEM202A6NGA9 273 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SEC14L5O43304 696 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OR10H3O60404 316 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SCN2BO60939 215 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GAB1Q13480 694 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GPR33Q49SQ1 333 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF628Q5EBL2 1059 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ADNP2Q6IQ32 1131 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF730Q6ZMV8 503 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TPRG1Q6ZUI0 275 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OR4K1Q8NGD4 311 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TM9SF4Q92544 642 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PIP5K1AQ99755 562 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PIGUQ9H490 435 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RDH14Q9HBH5 336 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 B4GALT6Q9UBX8 382 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GVC2 190 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF25A6NGN4 478 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 A6NIN4 97 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TMEM229AB2RXF0 380 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CHP2O43745 196 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 DPM1O60762 260 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LATS1O95835 1130 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 C2orf80Q0P641 193 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HKDC1Q2TB90 917 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 POM121L1PQ3SYA9 428 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 FRG2Q64ET8 278 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 IQCF1Q8N6M8 205 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 FIBINQ8TAL6 211 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 FRG2BQ96QU4 278 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TMEM43Q9BTV4 400 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PPA2Q9H2U2 334 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MTG2Q9H4K7 406 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SUV39H2Q9H5I1 410 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PRG6 482 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LEFTY2O00292 366 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TGM5O43548 720 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LGI1O95970 557 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 DHFRP00374 187 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SYPP08247 313 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SDHBP21912 280 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 AOAHP28039 575 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RAB8AP61006 207 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RBBP4Q09028 425 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SCARB2Q14108 478 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 C22orf39Q6P5X5 142 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 B3GLCTQ6Y288 498 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 USP45Q70EL2 814 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TMEM25Q86YD3 366 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GPR156Q8NFN8 814 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OR11H4Q8NGC9 324 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OR5AK3PQ8NH89 298 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MCOLN1Q9GZU1 580 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D17Q9HA65 648 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 FOLH1BQ9HBA9 442 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 UBQLN2Q9UHD9 624 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CDH10Q9Y6N8 788 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OR2AG2A6NM03 316 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 NR2F6P10588 404 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 STOMP27105 288 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CCR2P41597 374 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MAP2K6P52564 334 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TLE2Q04725 743 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PCDH1Q08174 1060 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MTAPQ13126 283 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF852Q6ZMS4 543 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CFAP77Q6ZQR2 320 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HTR3DQ70Z44 454 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OR4N4Q8N0Y3 316 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF366Q8N895 744 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SORCS1Q8WY21 1168 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GPR137Q96N19 417 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms