RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0X1KG70 313 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf226A1L170 272 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8A1P23610 371 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 S100GP29377 79 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM73Q86UV7 250 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52N2Q8NGI0 321 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASD1Q96PB1 797 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WASH4PA8MWX3 477 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSTT2BP0CG30 244 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRPRP30550 384 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRIA2P42262 883 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL26Q53HC5 615 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MINDY2Q8NBR6 621 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETD6Q8TBK2 473 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HCN2Q9UL51 889 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CMAHPQ9Y471 501 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM186AA6NE01 2351 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf74A8MZ97 194 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0YJX3 145 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CA3P07451 260 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF234Q14588 700 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLBQ86Z14 1044 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLITRK4Q8IW52 837 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRWD3Q6RI45 1802 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RP1P56715 2156 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSTM4Q03013 218 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCTD11Q693B1 232 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PGBD5Q8N414 524 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CST11Q9H112 138 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCO2O43819 266 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GP1BBP13224 206 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCKP27707 260 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HLA-FP30511 346 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LSMEM2Q8N112 164 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC39A13Q96H72 371 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGM7Q96PF1 710 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL23AQ9NPF7 189 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIPT1Q9Y234 373 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A6NHS1 94 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD8B2A6NJW9 211 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLRT2O43155 660 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD8BP10966 210 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRIT3Q3SXY7 679 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TLDC1Q6P9B6 456 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZIC5Q96T25 663 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.8■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLGAP1O14490 977 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAS6Q14393 721 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AAK1Q2M2I8 961 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPAT4Q86UL3 456 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM5Q9Y2B1 443 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPIPA5E9PKD4 350 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLKB1P03952 638 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TACR1P25103 407 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSD11B1P28845 292 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARPC4P59998 168 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15.79■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXJ1Q92949 421 aa15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms