RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476739.5

HDAC3-208, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-208ENST00000476739 FAM111BQ6SJ93 734 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 HSDL2Q6YN16 418 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ZNF227Q86WZ6 799 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CCDC116Q8IYX3 515 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 MDS2Q8NDY4 140 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ADCY4Q8NFM4 1077 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CLHC1Q8NHS4 586 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 FAM76AQ8TAV0 307 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CPT1CQ8TCG5 803 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 NUDT8Q8WV74 236 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 RNF32Q9H0A6 362 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CXorf56Q9H5V9 222 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CXorf21Q9HAI6 301 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 PNPOQ9NVS9 261 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 MYOTQ9UBF9 498 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 TEKT2Q9UIF3 430 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ZNF462Q96JM2 2506 aa9□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 PEX11AO75192 247 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 WISP2O76076 250 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ZFAND5O76080 213 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 LRATO95237 230 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 DRD2P14416 443 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 DDCP20711 480 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 S1PR1P21453 382 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 GRK2P25098 689 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 GALNSP34059 522 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 SLC37A1P57057 533 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 OR1C1Q15619 314 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 LGI4Q8N135 537 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 MIB2Q96AX9 1013 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 FBXL20Q96IG2 436 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 TSSK3Q96PN8 268 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 TAAR6Q96RI8 345 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 C1orf50Q9BV19 199 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 MYNNQ9NPC7 610 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 LRFN1Q9P244 771 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ZNF639Q9UID6 485 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 HAO1Q9UJM8 370 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.99□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 AKAP10O43572 662 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 PRAMEF2O60811 474 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 OR6B1O95007 311 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CBX7O95931 251 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ATP1B1P05026 303 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 BCKDHAP12694 445 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 PCSK2P16519 638 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 SOX3P41225 446 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 HLCSP50747 726 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 PMP22Q01453 160 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 FUT7Q11130 342 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 CEBPEQ15744 281 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 MPEG1Q2M385 716 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ZNF385BQ569K4 471 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ZNF766Q5HY98 468 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 LYPD8Q6UX82 237 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 MDGA2Q7Z553 956 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 LIX1Q8N485 282 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.98□□□□□ -0.97
HDAC3-208ENST00000476739 OR8K3Q8NH51 312 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms