RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476335.1

ELL3-204, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 2

Gene ELL3, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-204	ENST00000476335	FAM27E3	Q08E93	113 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	BIK	Q13323	160 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	DOC2A	Q14183	400 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF460	Q14592	562 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	TOMM20	Q15388	145 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	PACS2	Q86VP3	889 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	TAGAP	Q8N103	731 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	WNT2B	Q93097	391 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	MARK4	Q96L34	752 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	TM9SF2	Q99805	663 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ELL3-204	ENST00000476335	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	C8B	P07358	591 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	NID1	P14543	1247 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	PAX1	P15863	534 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	EPOR	P19235	508 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CRYGS	P22914	178 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	GGT5	P36269	586 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	MASP1	P48740	699 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	PCYT1A	P49585	367 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	C18orf63	Q68DL7	685 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	TANK	Q92844	425 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	TP53INP1	Q96A56	240 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	VPS39	Q96JC1	886 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CAPN14	A8MX76	684 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	GNB5	O14775	395 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CLGN	O14967	610 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	SNPH	O15079	494 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	SH3BGRL	O75368	114 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CCKAR	P32238	428 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CPOX	P36551	454 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CASP2	P42575	452 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	SSR2	P43308	183 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	DIO3	P55073	304 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	TNFRSF17	Q02223	184 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	SLAMF1	Q13291	335 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	GAB1	Q13480	694 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	E2F2	Q14209	437 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	TGFBI	Q15582	683 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	RIT1	Q92963	219 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	ESAM	Q96AP7	390 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	SNX15	Q9NRS6	342 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	WWOX	Q9NZC7	414 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ELL3-204	ENST00000476335	PSAT1	Q9Y617	370 aa		12.07	□□□□□ -0.48

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