RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MMP27	Q9H306	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TLR4	O00206	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NEBL	O76041	1014 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TSHB	P01222	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GNAZ	P19086	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CBL	P22681	906 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ATP5D	P30049	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	HLA-F	P30511	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MFAP5	Q13361	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ILK	Q13418	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KLC3	Q6P597	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PTER	Q96BW5	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NACA2	Q9H009	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LRP4	O75096	1905 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080		A8MXQ7	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PSMA7	O14818	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PCDH7	O60245	1069 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DFNA5	O60443	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZG16	O60844	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TNFSF15	O95150	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LDLR	P01130	860 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CD70	P32970	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PSMD8	P48556	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	THOP1	P52888	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KRT33B	Q14525	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GANC	Q8TET4	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KLK6	Q92876	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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