RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 RGS14O43566 566 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 AGFG2O95081 481 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 BPGMP07738 259 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 NEFHP12036 1026 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SOX3P41225 446 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC37A1P57057 533 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF763Q0D2J5 394 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CLEC18BQ6UXF7 455 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 IL20RBQ6UXL0 311 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF165Q6ZSG1 346 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF227Q86WZ6 799 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MMP21Q8N119 569 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC15A4Q8N697 577 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 POGLUT1Q8NBL1 392 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 DOK4Q8TEW6 326 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 C16orf78Q8WTQ4 265 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 FRMD6Q96NE9 622 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 EBPLQ9BY08 206 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 UTS2RQ9UKP6 389 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ENTPD4Q9Y227 616 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ACTL7BQ9Y614 415 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 COL12A1Q99715 3063 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RELNP78509 3460 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PS29 197 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 TM9SF1O15321 606 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC22BO75396 215 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 OR6B1O95007 311 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP1B1P05026 303 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CHRNGP07510 517 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 FGF4P08620 206 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PRPH2P23942 346 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 FEN1P39748 380 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 TDGF1P3P51864 188 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 FUT7Q11130 342 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 EBPQ15125 230 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PIGGQ5H8A4 983 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 KANK2Q63ZY3 851 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 GFRALQ6UXV0 394 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RTL4Q6ZR62 310 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 EXOC3L1Q86VI1 746 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 NUDCD3Q8IVD9 361 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CLYBLQ8N0X4 340 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 GOLM1Q8NBJ4 401 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PSD4Q8NDX1 1056 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 OR7G1Q8NGA0 311 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CDC26Q8NHZ8 85 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PGM2Q96G03 612 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SGCZQ96LD1 299 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 BRINP2Q9C0B6 783 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 WWTR1Q9GZV5 400 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 EHD3Q9NZN3 535 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 HEY2Q9UBP5 337 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC14L3Q9UDX4 400 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CFL2Q9Y281 166 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF407Q9C0G0 2248 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 NPIPB8E9PQR5 432 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZWINTO95229 277 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CT62P0C5K7 136 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF24P17028 368 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SSTR4P31391 388 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ETV4P43268 484 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINB4P48594 390 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MEOX1P50221 254 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RBPJQ06330 500 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf80Q0P641 193 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF750Q32MQ0 723 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SH2D4BQ5SQS7 431 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 NOXRED1Q6NXP6 359 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MDGA2Q7Z553 956 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 DDIASQ8IXT1 998 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 TAGAPQ8N103 731 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 OR10A5Q9H207 317 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 LRTM1Q9HBL6 345 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNK9Q9NPC2 374 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MYNNQ9NPC7 610 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf109Q9NX04 203 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAF6Q9Y4K3 522 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms