RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 BADQ92934 168 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 RAB7BQ96AH8 199 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 AMDHD1Q96NU7 426 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 BBS4Q96RK4 519 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 FNDC11Q9BVV2 318 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 CKAP5Q14008 2032 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 PRR23AA6NEV1 266 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 SMIM11AP58511 58 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 KRT33BQ14525 404 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 GPR19Q15760 415 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 C12orf73Q69YU5 71 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 C19orf48Q6RUI8 117 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ZNF793Q6ZN11 406 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 ASB16Q96NS5 453 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 KCNK6Q9Y257 313 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 A0A0A6YYD5 115 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 LRIT2A6NDA9 550 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 HAT1O14929 419 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 DRD3P35462 400 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TPTEP56180 551 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.159e-19■■■■■ 27
ACTB-207ENST00000462494 RHAGQ02094 409 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ZNF91Q05481 1191 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SPHARQ15513 63 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ZNF750Q32MQ0 723 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 OR8J1Q8NGP2 316 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 WDR26Q9H7D7 661 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 NT5DC2Q9H857 520 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 KCNK2O95069 426 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MYOGP15173 224 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 NTSP30990 170 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 GSTM5P46439 218 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 TAS2R38P59533 333 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MEDAGQ5VYS4 303 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PAQR6Q6TCH4 344 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 IQCHQ86VS3 1027 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SMARCD2Q92925 531 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MND1Q9BWT6 205 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ASPNQ9BXN1 380 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 AICDAQ9GZX7 198 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 EHD3Q9NZN3 535 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ADAM29Q9UKF5 820 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ACAD8Q9UKU7 415 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 UNC80Q8N2C7 3258 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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ACTB-207ENST00000462494 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SNPHO15079 494 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SCAMP1O15126 338 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 PRKYO43930 277 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SLAMF1Q13291 335 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 NCF4Q15080 339 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 OR8K5Q8NH50 307 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 SLC6A18Q96N87 628 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 FAIM2Q9BWQ8 316 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 ERVK13-1Q9NX77 482 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-207ENST00000462494 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.99■□□□□ 0.15
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