RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF639Q9UID6 485 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNA1CQ13936 2221 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR91A4D1P6 747 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 BLACEA4D250 179 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 G3V3Y1 287 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A12O75746 678 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 LRATO95237 230 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CBX7O95931 251 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT6AP02538 564 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 IL3P08700 152 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 NME2P22392 152 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 ALDH9A1P49189 494 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 AP2B1P63010 937 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 FUT7Q11130 342 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 RCN2Q14257 317 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF385BQ569K4 471 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM64Q6YI46 380 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 SIAH3Q8IW03 269 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 OLAHQ9NV23 265 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 FCHO1O14526 889 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 AZIN1O14977 448 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10H2O60403 315 aa6.47□□□□□ -1.37
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RABGEF1-206ENST00000461017 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00032P0C843 101 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL3P10147 92 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 EDN3P14138 238 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 CPMP14384 443 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-206ENST00000461017 PCSK2P16519 638 aa6.47□□□□□ -1.37
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