RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SOX8P57073 446 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MXRA7P84157 204 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PLIN5Q00G26 463 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 OGFOD2Q6N063 350 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP21Q8N119 569 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 LIX1Q8N485 282 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 M1APQ8TC57 530 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TSSK3Q96PN8 268 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 UTS2RQ9UKP6 389 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 GMEB1Q9Y692 573 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 BSNQ9UPA5 3926 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MUA0 341 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DYRK3O43781 588 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10H2O60403 315 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL41O60662 606 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 UNC5CO95185 931 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ACADSP16219 412 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CALB2P22676 271 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GALNSP34059 522 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CASRP41180 1078 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC26A5P58743 744 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CPZQ66K79 652 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 EPGNQ6UW88 154 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MAVSQ7Z434 540 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 EGLN2Q96KS0 407 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf50Q9BV19 199 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 REEP4Q9H6H4 257 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TBX19O60806 448 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPINA7P05543 415 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CPMP14384 443 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 EPHA3P29320 983 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL11P51671 97 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CHAF1BQ13112 559 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 BTBD16Q32M84 506 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NXNQ6DKJ4 435 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ACAD11Q709F0 780 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MORN4Q8NDC4 146 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MTERF3Q96E29 417 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 LHPPQ9H008 270 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 VCXQ9H320 206 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP25Q9NPA2 562 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 C5AR2Q9P296 337 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PCSK5Q92824 1860 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DPPA5A6NC42 116 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MUI8 341 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf105B2RV13 164 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 G6PDP11413 515 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPS1L1P21108 318 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 COLEC12Q5KU26 742 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RINLQ6ZS11 566 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GALNT16Q8N428 558 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms