RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ALG2Q9H553 416 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SERHLQ9NQF3 203 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ARL15Q9NXU5 204 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 BFARQ9NZS9 450 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HEY2Q9UBP5 337 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DAPP1Q9UN19 280 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PROCRQ9UNN8 238 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MED16Q9Y2X0 877 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 A0A096LNT2 108 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LRIT2A6NDA9 550 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SERINC4A6NH21 518 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SLC22A20A6NK97 555 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CDC7O00311 574 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 GUCA1CO95843 209 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IGKV3-11P04433 115 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CRHP06850 196 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PTPN7P35236 360 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 GMPRP36959 345 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CASP3P42574 277 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEA1P43355 309 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SLC6A12P48065 614 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NPY2RP49146 381 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RWDD2BP57060 319 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HERVK_113P63132 956 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ERVK-8P63133 956 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PCDH1Q08174 1060 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SETDB1Q15047 1291 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CYP1B1Q16678 543 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FAM166AQ6J272 317 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NEPROQ6NW34 567 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IFNEQ86WN2 208 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PRR22Q8IZ63 422 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR56A3Q8NH54 315 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HTRA1Q92743 480 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 KCNJ9Q92806 393 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DOCK7Q96N67 2140 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SERINC2Q96SA4 455 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IL22Q9GZX6 179 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SYBUQ9NX95 663 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FETUBQ9UGM5 382 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.379e-13■■■■□ 19.9
HDLBP-222ENST00000449504 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SYCE3A1L190 88 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 EMC8O43402 210 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FGF17O60258 216 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR10H2O60403 315 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DLX3O60479 287 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CGAP01215 116 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CD3EP07766 207 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CD8BP10966 210 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PPP3CBP16298 524 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 STT3AP46977 705 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RGS4P49798 205 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LHX2P50458 406 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ACTG1P63261 375 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FUT7Q11130 342 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.47□□□□□ -1.37
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