RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.1□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 VAPAQ9P0L0 249 aa6.1□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 COPZ2Q9P299 210 aa6.1□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.1□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ARGFXA6NJG6 315 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 NFKBIEO00221 500 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SULT1C4O75897 302 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ZNF432O94892 652 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LATS1O95835 1130 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PDGFAP04085 211 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ALPIP09923 528 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PET100P0DJ07 73 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 BCKDHAP12694 445 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 IL12BP29460 328 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 AKT2P31751 481 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 VIPR1P32241 457 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 KDELR2P33947 212 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PDX1P52945 283 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 NPRL3Q12980 569 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 CD244Q9BZW8 370 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 EQTNQ9NQ60 294 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ALG5Q9Y673 324 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 TRBC2A0A5B9 178 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MPC1LP0DKB6 136 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 JUPP14923 745 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MAP3K8P41279 467 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 KCNQ1P51787 676 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 DGKEP52429 567 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 FOXK1P85037 733 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 HSPB3Q12988 150 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 TRAM2Q15035 370 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PON3Q15166 354 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 VMACQ2NL98 169 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GTDC1Q4AE62 458 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ESCO2Q56NI9 601 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 IDNKQ5T6J7 187 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 RAB12Q6IQ22 244 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 REEP3Q6NUK4 255 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LINGO2Q7L985 606 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SNAPC3Q92966 411 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 NXPE2Q96DL1 559 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MYNNQ9NPC7 610 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LIPT1Q9Y234 373 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 FAAHO00519 579 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LRRTM2O43300 516 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 KDELR3O43731 214 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 DNAJB6O75190 326 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 UPK1BO75841 260 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PTTG1O95997 202 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MT-ND5P03915 603 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 HOXC12P31275 282 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SLC6A6P31641 620 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SOX9P48436 509 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 CTBP2P56545 445 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 NRG3P56975 720 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SEMG2Q02383 582 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ELOA3Q8NG57 546 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 THAP6Q8TBB0 222 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms