RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 PCTPQ9UKL6 214 aa19.31■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 POLQO75417 2590 aa19.3■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 GLOD5A6NK44 160 aa19.3■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 CAPN14A8MX76 684 aa19.3■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 COL6A2P12110 1019 aa19.3■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 C1orf185Q5T7R7 199 aa19.3■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 CLYBLQ8N0X4 340 aa19.3■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 C17orf47Q8NEP4 570 aa19.3■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 IKBKGQ9Y6K9 419 aa19.3■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 INHBAP08476 426 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 RFPL3SP0C7P2 107 aa19.29■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 CCNG1P51959 295 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF3Q13114 568 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6KA2Q15349 733 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 TAOK1Q7L7X3 1001 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 PAGE2Q7Z2X7 111 aa19.29■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 NEIL3Q8TAT5 605 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1E2Q96A05 226 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB26Q9HCK0 441 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 AHSPQ9NZD4 102 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 XPR1Q9UBH6 696 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 NCKAP5O14513 1909 aa19.29■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JNJ9 132 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 TP53I11O14683 189 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 PGRMC2O15173 223 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM24O75264 130 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 CNTFP26441 200 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3R1P27986 724 aa19.28■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa19.28■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF615Q8N8J6 731 aa19.28■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 PHF21BQ96EK2 531 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF597Q96LX8 424 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 DOHHQ9BU89 302 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 EXO5Q9H790 373 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF358Q9NW07 568 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 Q9UFV3 132 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF180Q9UJW8 692 aa19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 KRT38O76015 456 aa19.27■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 RPS17P08708 135 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 SSTR4P31391 388 aa19.27■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa19.27■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 METTL4Q8N3J2 472 aa19.27■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 OR7G1Q8NGA0 311 aa19.27■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 OR4K14Q8NGD5 310 aa19.27■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 DOK4Q8TEW6 326 aa19.27■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 ADIPOR1Q96A54 375 aa19.27■□□□□ 0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa19.27■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 OR10A5Q9H207 317 aa19.27■□□□□ 0.68
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 EXPH5Q8NEV8 1989 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PS29 197 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 SNX4O95219 450 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 ACSL3O95573 720 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 KLK1P06870 262 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 ADH7P40394 386 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 NRG3P56975 720 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf163Q5TEZ5 329 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM198Q66K66 360 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 MMGT1Q8N4V1 131 aa19.26■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 SPPL2AQ8TCT8 520 aa19.26■□□□□ 0.67
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