RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 PPP2R5CQ13362 524 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 VWA2Q5GFL6 755 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 LIPJQ5W064 366 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 PEX5LQ8IYB4 626 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 OR6T1Q8NGN1 323 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 GPR137Q96N19 417 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TMEM245Q9H330 911 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 VPS54Q9P1Q0 977 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ARMCX1Q9P291 453 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TEX264Q9Y6I9 313 aa3.3□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TRIM49BA6NDI0 452 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 HSF2BPO75031 334 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 OLFM2O95897 454 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SERPINF2P08697 491 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ABHD2P08910 425 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ZNF18P17022 549 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 FCARP24071 287 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 PPP2R1BP30154 601 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ELK3P41970 407 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CDKL1Q00532 357 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CRMP1Q14194 572 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CMPK2Q5EBM0 449 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SLC10A5Q5PT55 438 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 RDH11Q8TC12 318 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 MGARPQ8TDB4 240 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ATP6V0A1Q93050 837 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SLCO4A1Q96BD0 722 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 NTNG2Q96CW9 530 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CAPNS2Q96L46 248 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CARD9Q9H257 536 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 DCTPP1Q9H773 170 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 Q9HAA7 133 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 HMG20BQ9P0W2 317 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.29□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 AFF2P51816 1311 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SYCE3A1L190 88 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TRIM64A6NGJ6 449 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TRIM64BA6NI03 449 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CHEK1O14757 476 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 HLA-DPA1P20036 260 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 HMGCLP35914 325 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TNFRSF4P43489 277 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 BRCC3P46736 316 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ZNF131P52739 623 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 SLC12A3P55017 1021 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CCZ1BP86790 482 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CBX3Q13185 183 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 ASRGL1Q7L266 308 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 BNIPLQ7Z465 357 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 GPR142Q7Z601 462 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 BEST4Q8NFU0 473 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 NEK11Q8NG66 645 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 AGAP11Q8TF27 550 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 APPL1Q9UKG1 709 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.28□□□□□ -1.88
RBM39-211ENST00000426951 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms