RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHX3Q9H6B9 360 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 A4GALTQ9NPC4 353 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 DKK3Q9UBP4 350 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PDPK1O15530 556 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 RORCP51449 518 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 BAK1Q16611 211 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PGBD2Q6P3X8 592 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 NRSN1Q8IZ57 195 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC7A13Q8TCU3 470 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 COQ10AQ96MF6 247 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 MVB12BQ9H7P6 319 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC28A3Q9HAS3 691 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC14L4Q9UDX3 406 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 V9GYH0 126 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 NCF4Q15080 339 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP6Q16828 381 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMC4Q5T2S8 1044 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf73Q69YU5 71 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 OLIG3Q7RTU3 272 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGN2P46Q86SG4 172 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT78Q8N1N4 520 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5P2Q8WZ92 322 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TMCO6Q96DC7 493 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TIGARQ9NQ88 270 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC14L3Q9UDX4 400 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF221Q9UK13 617 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 STUB1Q9UNE7 303 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC4Q9Y296 219 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGN4O00479 90 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FAAHO00519 579 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINT1O43278 529 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 HTR3AP46098 478 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 RUNX1T1Q06455 604 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 HEPACAMQ14CZ8 416 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM69Q86WT6 500 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM129CQ86XR2 697 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 NANOGP1Q8N7R0 232 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CHAC2Q8WUX2 184 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 AHSPQ9NZD4 102 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TAC3Q9UHF0 121 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FEZF1A0PJY2 475 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC85CA6NKD9 419 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 MYL12BO14950 172 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC28A2O43868 658 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ACADLP28330 430 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TAB1Q15750 504 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SYPL1Q16563 259 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM201Q5SNT2 666 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf183Q5T699 404 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD4BQ5TF39 518 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF544Q6NX49 715 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 OR8J1Q8NGP2 316 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM203Q969S6 136 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 NUS1Q96E22 293 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF354BQ96LW1 612 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MV72 311 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CISD3P0C7P0 127 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 GSTM5P46439 218 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ5P48544 419 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTN1Q12860 1018 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF79Q15937 498 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM92BQ6ZTR7 304 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 UBQLNLQ8IYU4 475 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD53Q8N9V6 530 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6F1Q8NGZ6 308 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 UCN3Q969E3 161 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 YIPF2Q9BWQ6 316 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 NDOR1Q9UHB4 597 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SSR3Q9UNL2 185 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R3H8 397 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKYO43930 277 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP20O60882 483 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CDRT1O95170 752 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF19O95750 216 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ATAD3CQ5T2N8 411 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5D16Q8NGK9 328 aa17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms