RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP3R2Q96LZ3 170 aa25.27■■□□□ 1.64
GNPTAB-202ENST00000392919 SLX1AQ9BQ83 275 aa25.27■■□□□ 1.64
GNPTAB-202ENST00000392919 MYNNQ9NPC7 610 aa25.27■■□□□ 1.64
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
GNPTAB-202ENST00000392919 PEX11AO75192 247 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 DDAH2O95865 285 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC35E2P0CK97 266 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 EDN3P14138 238 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 XKP51811 444 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 PLIN5Q00G26 463 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 HEPACAMQ14CZ8 416 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 MORN4Q8NDC4 146 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 NCLNQ969V3 563 aa25.26■■□□□ 1.63
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GNPTAB-202ENST00000392919 RNF32Q9H0A6 362 aa25.26■■□□□ 1.63
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GNPTAB-202ENST00000392919 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 TMED5Q9Y3A6 229 aa25.26■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 OR5H15A6NDH6 313 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 MAN1A2O60476 641 aa25.25■■□□□ 1.63
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GNPTAB-202ENST00000392919 HK2P52789 917 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 C2orf80Q0P641 193 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 C4orf17Q53FE4 359 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.25■■□□□ 1.63
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF321PQ8N8H1 164 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CDC26Q8NHZ8 85 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 DOK4Q8TEW6 326 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 VMP1Q96GC9 406 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 EGLN2Q96KS0 407 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 PFDN4Q9NQP4 134 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 OLAHQ9NV23 265 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 PSME2Q9UL46 239 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 OSGIN2Q9Y236 505 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ZGRF1Q86YA3 2104 aa25.25■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 OR10H2O60403 315 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CPMP14384 443 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 SDC1P18827 310 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 GALNSP34059 522 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM180BQ6P0A1 224 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 BEST3Q8N1M1 668 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC2A12Q8TD20 617 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 KLHL29Q96CT2 875 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 TUBGCP3Q96CW5 907 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R36Q96LQ0 422 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 C5orf34Q96MH7 638 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF681Q96N22 645 aa25.24■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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GNPTAB-202ENST00000392919 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa25.23■■□□□ 1.63
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GNPTAB-202ENST00000392919 CLDN1O95832 211 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 BCKDHAP12694 445 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 PORP16435 677 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 DDCP20711 480 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 FEN1P39748 380 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CLCN2P51788 898 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 TDGF1P3P51864 188 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 DUSP2Q05923 314 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 PRSS53Q2L4Q9 553 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ACER2Q5QJU3 275 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CRLF3Q8IUI8 442 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF721Q8TF20 911 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 NUF2Q9BZD4 464 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 OR8D2Q9GZM6 311 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 EHD3Q9NZN3 535 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 TEKT2Q9UIF3 430 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP8B1O43520 1251 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 COL8A1P27658 744 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 IKBIPQ70UQ0 350 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 RIT1Q92963 219 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 DEFB126Q9BYW3 111 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 AKTIPQ9H8T0 292 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CXorf21Q9HAI6 301 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD10Q9NXR5 420 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRTM2O43300 516 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 IGKV3-11P04433 115 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 TICAM1Q8IUC6 712 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC5A8Q8N695 610 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 FNDC5Q8NAU1 212 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC8CQ8TDW0 803 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 NR4A3Q92570 626 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXL20Q96IG2 436 aa25.21■■□□□ 1.63
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