RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 CPEP16870 476 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 XPAP23025 273 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GPC1P35052 558 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RNLSQ5VYX0 342 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZER1Q7Z7L7 766 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RDH10Q8IZV5 341 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OR5D16Q8NGK9 328 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TM9SF2Q99805 663 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CTPS2Q9NRF8 586 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SNX7Q9UNH6 387 aa17.8■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SPINT1O43278 529 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 IL1AP01583 271 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 WEE1P30291 646 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PTGER1P34995 402 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RPS5P46782 204 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CD83Q01151 205 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 C1DQ13901 141 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NFE2L1Q14494 772 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GINS1Q14691 196 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GPAT3Q53EU6 434 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZNF438Q7Z4V0 828 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RAET1EQ8TD07 263 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TCEAL4Q96EI5 215 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TMCC2O75069 709 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 RAB36O95755 333 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 EPPINO95925 133 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MAPK12P53778 367 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 XKRXQ6PP77 449 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SHFQ7M4L6 423 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FAM129CQ86XR2 697 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FAM26EQ8N5C1 309 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZFP41Q8N8Y5 198 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD53Q8N9V6 530 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GALNT6Q8NCL4 622 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OR5P2Q8WZ92 322 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 KATNB1Q9BVA0 655 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TOR4AQ9NXH8 423 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SEC14L3Q9UDX4 400 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 IL36AQ9UHA7 158 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PRKAB1Q9Y478 270 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MAU2Q9Y6X3 613 aa17.79■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CCDC182A6NF36 153 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PDPK1O15530 556 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SLC28A2O43868 658 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SH3BP5O60239 455 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NTN1O95631 604 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OR12D1P0DN82 309 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 MYL9P24844 172 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SPDYE7PQ495Y7 208 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 ZNF805Q5CZA5 627 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NOXA1Q86UR1 476 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 VWA5B2Q8N398 1253 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 OR52P1PQ8NH57 321 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 GATAD2BQ8WXI9 593 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 KCNK12Q9HB15 430 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LHX9Q9NQ69 397 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FBXW2Q9UKT8 454 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 COL4A3Q01955 1670 aa17.78■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 WASHC1A8K0Z3 465 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 NDUFB5O43674 189 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LGI1O95970 557 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LRG1P02750 347 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 EPHX1P07099 455 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TSPAN19P0C672 248 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TRAPPC2P0DI81 140 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 TRAPPC2BP0DI82 140 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 SYN1P17600 705 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 BSGP35613 385 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 CNTN1Q12860 1018 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FAM214AQ32MH5 1076 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PYDC2Q56P42 97 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 LY6G5CQ5SRR4 150 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 PAMR1Q6UXH9 720 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 WASH2PQ6VEQ5 465 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 FAM92BQ6ZTR7 304 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 C11orf74Q86VG3 221 aa17.77■□□□□ 0.44
CITED2-201ENST00000367651 IQCHQ86VS3 1027 aa17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms