RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SULF2Q8IWU5 870 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 GHDCQ8N2G8 530 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF721Q8TF20 911 aa7.1□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 CCDC120Q96HB5 630 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ART5Q96L15 291 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZIM3Q96PE6 472 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM237Q96Q45 408 aa7.1□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 AHSPQ9NZD4 102 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.1□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPB8 328 aa7.09□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRS3 328 aa7.09□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.09□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.09□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC13O75165 2243 aa7.09□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PS29 197 aa7.08□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 OR6C76A6NM76 312 aa7.08□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.08□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 G3V2L1 256 aa7.08□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 G3V3Y1 287 aa7.08□□□□□ -1.28
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